Hlavné postavy: Walter (robot), David (robot), Daniels, Tennessee, Oram, Ferisová, Karin

Udalosti pred misiou vesmírnej lode Prometheus

Aktivoval sa robot. Weyland sa s ním krátko porozprával o stvorení a Tvorcoch a nechal ho, nech sa sám pomenuje - vyberie si meno David, po soche Dávida. Následne mu Weyland "ukáže" že je len sluha tým, že mu prikáže, aby mu podal vodu, ktorá je hneď vedľa neho.

Udalosti na kolonizačnej lodi Covenant

Walter vykonáva na kolonizačnej lodi Covenant bežnú údržbu, kým ho palubný počítač, Matka, neupozorní na neutrónovú vlnu, ktorá môže poškodiť loď a spustí pohotovostný proces oživovania posádky lode. Pri oživení zlyhá mraziaci box kapitána lode, manžela Daniels a on zhorí.

Nový kapitán Oram prikáže Daniels odpočinok. Tá sa v kabíne trápi a balí mužove veci. Po chvíli sa vzoprie Oramovmu príkazu a spolu s robotom Walterom prezerajú stroje, ktoré má na starosti a hovorí mu o mužovom sne postaviť chatu pri jazere na novom svete. Walter sa ponúkol, že jej pomôže.

Oram zvolá posádku a snaží sa ju povzbudiť a inštruovať, ale zisťuje, že nemá medzi nimi absolútne žiadny rešpekt. Dôkazom je aj to, že sa Walter, Daniels, Tennessee a jeho žena Ferrisová vykonajú kapitánov pohreb vypustením tela do vesmíru. Majú niekoľko hodín, kým sa ľoď môže znova pustiť na cestu a oni budú nútení vrátiť sa do kryokapsúl.

Počas opráv je Tennessee vo vesmíre a jeho oblek zachytí signál. Po analýze zvuku a čiastočného obrazu v ňom Tennessee spozná starú pesníčku. Matka nájde zdroj vysielania a výsledkom je planéta, ktorá je pre ľudí ešte vhodnejšia ako tá, na ktorú Covenant cestuje. Po hádke medzi členmi posádky, či sa na tú planétu vydať alebo nie, sa rozhodne, že preskúmajú planétu, z ktorej pochádza signál.

Ferrisová vezme skupinu výskumníkov a vojakov na planétu cez veľmi zlú búrku. Burka im spôsobí ťažkosti s komunikáciou a miestami až úplne znemožní kontakt s Covenantom. Ferrisová pristane niekoľko kilometrov od zdroja, a tak sú všetci nútení vydať sa na túru naprieč krajinou, lesom a kopcami. Po pár kilometroch zostáva Karin s jedným vojakom pozadu a zbiera vzorky. Vojak zakopne o, na prvý pohľad neškodný, útvar a naruší krustu, z ktorej sa vznesú spóry. Spôry sa sformujú a infikujú vojaka, s ktorým je Karin nútená po chvíli zísť naspäť k lodi a Informovať Ferrisovú nech pripraví karanténnu miestnosť.

Druhá skupina nájde spálenú krajinu, ktorá ide smerom k signálu a následne nájdu havarovanú materskú ľoď. Po krátkom prieskume nájdu pozostatky obydlia Elizabeth Shawovej, ktorá bola členkou posádky lode Prometheus. Nájdu zdroj signálu a aktivujú (niečo ako) lodný počítač. V lodi sa nachádzajú ďalšie spóry a infikujú ďalšieho vojaka. Začujú Karinino volanie a vydajú sa naspäť k lodi.

Vojak sa dostáva do šoku a krváca odvšadial. Vydesená Ferrisová ich zamkne do karanténnej miestnosti a volá Covenant. Nejakým zázrakom sa s nimi spojí a Tennessee počuje jej vydesený hlas, no nerozumie jej a veľmi zle ju počuje. Z infikovaného vojaka sa vyliahne neomorph a rastie Karin priamo pred očami. Zabije Karin, na čo sa pozerá vydesená Ferrisová a následne sa neomorph dostane z karantény a snaží sa zabiť aj ju. Ferrisová uteká a omylom strelí do nádrží s horľavinou a loď vybuchne. Neomorph utečie z lode do okolia.

Loď vybuchla, keď bol výskumný tým kúsok od nej a zároveň sa z druhého infikovaného vojaka liahne druhý neomorph. Obaja neomorphovia zaútočia na zvyšok posádky. Tajomná postava ich zaženie a posádku následne odvedie do relatívneho bezpečia - svojho útočiska.

Vydesený Tennessee chce s Covenantom pristáť na planéte, čo ale môže zničiť celú loď aj s kolonistami. S ďalšími členmi posádky vedú diskusiu o alternatívach, priblížia sa k búrke koľko je to možné a ľoď zostala stabilizovaná aby nadviazali sidnál. Po čase sa s výskumným tímom spoja a rozhodnú sa použiť vesmírny výťah, z ktorého demontujú všetko nepotrebné na odľahčenie.

David hovorí preživším kto je a ako s Elizabeth pochádzajú z lode Prometheus a pri pokuse pristáť na tejto planéte omylom uvoľnil vírus, ktorý zničil všetko živé na planéte a medzi nimi bola aj Elizabeth. Následne odvedie vojakov na strechu, kde zriadia stanovisko a snažia sa spojiť s Covenantom.

Walter a David vedú rozhovor, počas ktorého ho David učí hrať na píšťalke. Keďže je medzi modelmi niekoľkoročný rozdiel David má zachovalú schopnosť tvoriť, ktorú Walter nemá. Po rozhovore ide Walter za Daniels a povie jej svoje pochybnosti o Davidovom správnom fungovaní. Dekáda bez kontaktu s inteligentným tvorom a údržby nie sú preskúmané a podľa neho David nie je v poriadku.

Vojačka sa vybrala do "umývarne" vymyť si rany z boja s neomorphom a keď sa dlho nevracia a nehlási na vysielačke Oram ju ide nájsť. Oram našiel Davida, ako sa na neomorpha pozerá, nič nerobí a v miestnosti je mŕtva vojačka. Zabije neomorpha a David vydá hysterický krik, ale rýchlo sa vráti do role androida. Oramovi chce ukázať svoj výskum a zavedie ho do jednej zo svojich pracovní, ktorá má svoju pivnicu. Hovorí mu svoje poznatky o víruse, ako je umelo vytvorený Tvorcami, ako je naprogramovaný pretvárať všetko živé na planéte a má schopnosť prežiť niekoľko dekád a hybernovať, ako bol ten vírus vytvorený na to aby zničil ľudstvo a pod. Následne ho zavedie do pivnice a tam ho napadne jeden z jeho projektov a infikuje ho zárodkom, z ktorého sa po čase vyliahne xenomorph a David je toho svedkom.

Vojakom sa podarí nadviazať spojenie s Covenantom a Daniels povedia o svojom pláne použiť výťah ako náhradnú loď na vyzvihnutie posádky a všetci sa majú zbaliť.

Walter nájde v inej Davidovej pracovni jeho podrobné nákresy vnútorností Elizabeth Shawovej. David sa mu prizná, že náhodné uvoľnenie vírusu nebola nehoda. Počas jedného z rozhovorov David zle určil citát a Walter mu to teraz pripomenie. David si uvedomí, že ak sa mýlil raz, mohol sa zmýliť už predtým. Deaktivuje Waltera vrazením píšťalky do krku. Walter má systémové vylepšenia oproti Davidovi a píšťalka v krku spustí reboot systému a opravný proces.

David nájde Daniels a povie mu o tom ako ju chce použiť na svoje ďalšie experimentovanie. David prekvapene pozerá na Waltera, ktorý zachráni Daniels a pripomenie mu systémové zmeny modelov. Nasledne medzi mini nastane boj.

Vojaci hladajú Orama, aby mu povedali o novinkách, ale nájdu len telo s dierou v hrudi a vajcia. Jedno z vajec sa uvoľní a pri snahe ho dostať zo sežanta sa uvoľní kyselina z rany a poleptá mu tvár, zatiaľ čo druhý vojak je zabitý xenomorphom. Daniels zoberie poletaného seržanta a utekajú spolu na námestie čakať na Tennesseeho.

Seržant, Daniels, "Walter" a xenomorph sa dostanú na plavidlo. Xenomorph sa nesmie dostať na Covenant a Daniels sa ho podarí zabiť a idú domov.

Sežanta odvedú do vyšetrovacej miestnosti a zastavia leptanie ďalšej sliznice a stabilizujú ho. Keď už si všetci na lodi vydýchli, tak im Matka oznamuje, že je na lodi neznámy tvor a seržant je mŕtvy. Tennessee s pomocou Daniels a "Waltera" zabijú xenomorpha a prídu o ďalších členov posádky a pripravujú sa na kryospánok. Pri uspávaní sa Daniels sp´´yta "Waltera", či mu pomôže postaviť jej dom pri jazere, ale "Walter nereaguje". Daniels dôjde, že nejde o Waltera, ale s krikom upadá do kryospánku.

Po uložení všetkých do kryospánku "Walter" použije aktivačný kód Davida do časti lode s embryami a kolonistami a ukradá svoje zárodky z experimentov medzi ľudské embryá. Skutočného Waltera nechali na mŕtvej planéte a Davida zobrali zo sebou.